黄瓜生长的不同阶段会遭受不同病害的侵袭。但有着阶段性的规律。只要进行有效地防治，就能合理的控制黄瓜苗的涨势。
苗床选得好黄瓜长势好，苗床的选择，可设在高燥，排灌方便的壤土地块，例如，冬季在暖被棚里育苗，应当对土质和肥料合理搭配。
偏方有利于壮苗：在营养土壤中，按照1:300的比例加入白糖，可以使黄瓜苗生长势力强劲，并对黄瓜的抗病能力和预防有着很好的。
幼苗出土之后，采用64%的杀毒液70%，甲基托布津WP1000～1200倍液混合喷雾，能够预防猝倒病和立枯病。
枯萎病在黄瓜节瓜时出现，为了防止出现可以采用劈接的方式嫁接，提高嫁接质量，避免急性枯萎病的发生。
黄瓜后期有可能患白粉病、红粉病，用药15%粉锈宁WP1500倍液;50%翠贝干悬浮2000倍液;40%杜邦福星1500倍液交替喷雾。