三尊佛分别有以下的组合形式︰
1、释迦三尊︰以释迦如来为主尊；左右两胁侍则或为文殊、普贤二菩萨（此称华严三圣），或为多罗与观自在菩萨，或为药王与药上菩萨，或为迦叶与阿难，或为观音与执金刚，或为梵天与帝释
2、阿弥陀三尊︰以阿弥陀如来为主尊；左右两胁侍为观音与势至二菩萨。
3、药师三尊︰以药师如来为主尊；左右两胁侍为日光与月光二菩萨。