主要用作汽油添加剂,具有优良的抗爆性,提高辛烷值,亦可裂解制得异丁烯。它与汽油的混溶性好,吸水少,对环境无污染,能改善用作分析溶剂、萃取剂,在色谱中尤其是高压液相色谱中用作脱剂,与一些极性溶剂如水、甲醇、乙醇等形成共沸物。甲基叔丁基醚还有轻度麻醉作用。